六道仙人：
人称忍者始祖，十尾人柱力，轮回眼拥有者；
木叶十二忍：
木叶的十二位新一代杰出忍者的统称，有漩涡鸣人、春野樱、日向雏田、日向宁次、李洛克、天天、犬冢牙、油女志乃、奈良鹿丸、秋道丁次、山中井野，及已经叛离的宇智波佐助；
晓组织：
一个由10名S级逃亡忍者组成的秘密组织。成员：零葬-佩恩、青龙-迪达拉、白虎-小南、朱雀-宇智波鼬、玄武-绝、空陈-大蛇丸（已脱离，被封印）、南斗-干柿鬼鲛、北斗-角都、三台-飞段、玉女-赤砂之蝎（死后由宇智波斑，也就是阿飞代替）。现存2人：绝、宇智波斑（加上佐助的鹰小队，总共6人）；
三忍：
自来也（与佩恩战斗死亡，临死前由蛤蟆传出暗号）、大蛇丸、纲手；
忍刀七人众：
水之国雾隐村的精英忍者，目前有四人出场，桃地再不斩、干柿鬼鲛、黑锄雷牙(动画原创）、长十郎。（再不斩，雷牙，干柿鬼鲛已死）；
音忍五人众：
君麻吕（与我爱罗和李洛克对战时因病而亡）、鬼童丸、左近、多由也、次郎坊（全部阵亡）；
猪鹿蝶：
山中亥一、奈良鹿久、秋道丁座 （父一代）；山中井野、奈良鹿丸、秋道丁次（子一代）；
宇智波一族：
原有宇智波带土（止水的哥哥）、宇智波佐助、宇智波鼬（佐助的哥哥）、宇智波斑、宇智波泉奈、宇智波富岳（佐助、鼬之父）、宇智波美琴（佐助、鼬之母）、宇智波止水、，现仅剩宇智波佐助、宇智波斑；
日向一族：
日向宁次、日向雏田、日向日差（宁次之父，已死）、日向花火、日向日足（雏田、花火之父）；
油女一族：
油女志乃（子）、油女志微（父）；油女取根；
山中一族：
山中井野（子），山中亥一（父）；
森之千手一族：
千手柱间、千手扉间、千手纲手、千手绳树；（除纲手外全部阵亡）。
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