2002-2003：

　　木叶毁灭计划失败后，满目疮痍的木叶百废待兴，首要任务则是需要找到下一任火影，为此，自来也带着鸣人去寻找另一位三忍——医疗忍者纲手；而被三代目用“尸鬼封尽”封印双手的大蛇丸也前来寻找纲手请她为其治疗。冤家路窄，三忍终于爆发了大战……

　　翻开第四话的扉页就会发现，三忍的构想是从创作最初就存在的。

　　自来也、大蛇丸、纲手三个名字均来源于30年前的日本民间故事《儿雷也豪杰物语》。其中儿雷也(自来也)是一名可以召唤巨大蛤蟆的忍者，他是九州岛的一个强大部落的继承人。儿雷也爱上了纲手，一个善于操纵蛞蝓的美丽公主。而他们在故事中的对手则是大蛇丸，顾名思义擅于召唤毒蛇，并曾用毒毒害儿雷也、纲手夫妇。

　　与此同时，火影第二部的主线——“晓”组织也随着宇智波鼬的归乡浮出水面。俊美的脸庞，高超的实力，比卡卡西还要神秘的万花筒写轮眼——“天照”，“月读”……宇智波鼬一出场便聚集了大量人气，他的出现也揭露了佐助复仇的原因。

　　宇智波一族的创作大量借鉴了日本古代传统神话。天照，月读是日本神话中的神明，须佐能乎，伊邪纳岐也有各自的来历。而且可以确定的是，《火影忍者》在某些方面借鉴了富坚义博的《幽游白书》，关于这一点，岸本齐史在与富坚义博的对话中谈到，影分身的想法源于《幽游白书》中朱雀的暗黑妖龙阵，而宇智波鼬的“天照”则借鉴了《幽游白书》中飞影的魔界黑火焰。

　　当年由于挖了“晓”这个坑，群众热情很高，关于“晓”首领的猜测充斥着各大论坛，其中呼声最大的竟然是四代火影的说法。

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